由緒ある英国貴族、ジョージI世(ジョースター家の当主)の一人息子。
当初は体格は人並で、貴族の息子とは思えないほど行儀が悪く、いじめられっ子の傾向もあった。しかし、いじめっ子から少女(エリナ)を守ろうとするなど、紳士的な部分も備わっていた。
ジョースター家の養子となったディオ・ブランドーと出会い、運命が大きく動く。自分の物を盗られたり、友達に悪い噂を流され孤立させられるなど、ディオの策略により腑抜けにさせられそうになる。その後、エリナと再会し、相思相愛になるが、ディオがエリナを奪おうとしたため、またも孤立する。しかし、エリナの心を侮辱したディオに対して激怒し、行動することによって成長を遂げた(ディオはその報復として、ジョナサンの愛犬のダニーを焼き殺す)。
ダニーの死から7年。ジョナサンは身長195cmの巨漢に成長し、大学ラグビーで活躍する傍ら、考古学を勉強するようになっていた。ディオが養父(ジョナサンにとっては実の父)を毒殺しようとした時は、証拠をつかむ為に死をも覚悟し貧民街に行く。正義感が強くなり、行動力も備わっていた。ディオが父を殺し吸血鬼と化した時は、死闘の末、彼を倒した。その戦いで重傷を負い、偶然にもエリナが勤める病院に担ぎ込まれた事で彼女と再会する。
その後ツェペリと出会い、ディオが生き残って辺境の村で潜伏している事を知らされると、彼を倒すべく「仙道(波紋)」を習得、戦いに赴く。強敵を倒し、仲間の死を乗り越えたジョナサンはさらに成長を遂げ、ディオとの戦いに再び勝利した。
2か月後、エリナ・ペンドルトンと結婚。新婚旅行中、首だけ生き残ったディオに不意打ちをくらい、その行動を阻止することには成功したが死亡する。
ディオはその後ジョナサンの体を奪い、皮肉にもPart3で子孫である承太郎達を苦しめることになる。その一方で、Parte5に登場するディオの息子・ジョルノに、ジョナサンの因子が受け継がれることともなった。
歴代ジョジョのなかでは最も真面目で優等生な主人公である。
パンチをくりだしつつ、関節を外してその痛みを波紋? で和らげてリーチを延ばす技。 中国人の薬屋?をやっつけた。 しかし、関節をどうやって外すのだろうか
波紋を拳に集中し、一気に叩き込む技。 最も強い威力を誇る
水中に波紋を走らせ、遠くまで伝達させる技 北斗の拳?のユダ?の南斗紅鶴拳と似ている
金属に波紋を伝える技ブラフォード?から託された剣で 使用
皮膚を通して波紋を流す技 吸血鬼の血もこれで吹き飛ばせるようだ
ダニーをディオに蹴られたときに発した 只の印刷ミスだが、かなりの年月放置されていた
DIOをボコボコにしたときに言った。 果たして本当に止めるつもりだったのか。
ボクシングでめん玉を指で突かれたときに発した。 冷静すぎて逆に怖い