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今日の予定
- **:**
- @研究室。ぽーるとぱぱが来る。
- **:**
- @研究室。序論と結論のストーリー展開を見直し、改良する。
- **:**
- @自宅。ハンバーグを作る。
to do List
- 修論残り(dead line = 8/31)
- 結果
- dot-plot 図の描きなおし
- 初期値依存性についての評価を改善
- 考察
- 謝辞
- 修論研究の投稿
- イントロダクション,ディスカッションのストーリーの練り直し。
- 練り直しに伴う、追加実験
- 博士課程進学手続き等
- COE研究員RA申請 (dead line = 9/4 16:00)
今日考えたことのメモ
- 僕の修論は、Result Paper か? Method Paper か?
- Method Paper である。
- それでいて、Result Paper になろうともしている。
- では、イントロダクション,ディスカッションのストーリー展開は、Result Paper,Method Paper のどちらの展開を選択するか?
- イントロダクションでは Method Paper の展開を選択し,ディスカッションでは Result Paper の展開を選択してみようと思う。
- 独特で面白いでしょ!?
- 比較ゲノム解析には、どんな解析があるんだろう?
- ぱっと思いつくのは、以下の通り。
- シンテニー発見
- オーソログ発見 ⇒ 遺伝子機能解析
- ゲノム再編成シナリオの推定 (Reversal,Duplication etc.)
- まー。Comparative Genomics とか、ゲノムブラウザーとかを見るに、こんな感じで良いんじゃないかなぁ。
- 序論の導入部を描いていて、Key Word による話題の推移の威力を実感。すげぇ。すげぇ。
- シンテニー領域と局所的ゲノムアライメント領域の違いって何!?
- シンテニー領域は、ゲノム全体を俯瞰的に観察するために同定するもの。局所的ゲノムアライメント領域は、近隣遺伝子間の関係を観察するために同定するもの。
- シンテニー領域はゲノムスケールな領域であり、約20〜100個程度の遺伝子を含む領域である。局所的ゲノムアライメント領域は必ずしもゲノムスケールな領域ではなく、5〜10個程度の遺伝子を含む領域である。
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