FrontPage / 2006-04-12

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今日の予定

to do List

• Gumbel Extreme Distribution パラメータ (λ，K lnKmn) の推定
  • Poisson Approximation Method の適用
  • 最小自乗法の勉強
  • 繰り返し回数の検討
  • スコア行列，ギャップペナルティの検討
  • パラメータの m, n 依存性の検討
  • パラメータの ln[n/m] 依存性の検討
• Whoda 関連
  • sce-ago.ortho を用いて、sce-ago に Whoda を適用したときの評価を行う。
  • アンカー間の配列相同性のチェックに、線形時間アルゴリズムを適用してみる。そのときに必要な計算時間と対応精度の評価を行う。
• 奨学金
  • 慶應義塾大学大学院奨学金
    • 大学院奨学金申請書
    • 出願票
    • 大学院奨学金参考資料
    • 成績証明書
    • 所得証明書
    • 所得関係各種書類
    • 通帳またはキャッシュカードのコピー
• TA
  • 実装したプログラムを用いて考察 (2 章)
    • 課題を実際にやってみる
  • E-Cell のダウンロードとテキストを用いた演習 (3 章)
  • wiki ページの作成 (1 章)
    • 課題
  • wiki ページの作成 (2 章)
• オーソログ発見アルゴリズム (PickOrtho?) の考案とプログラムの実装
  • Aho-Corasick モジュールの作成
  • Extend モジュールの作成
  • DP モジュールの作成
  • パラメータ設定についての勉強
• 雑務
  • 財布の盗難について警察へ届出
  • みずほ銀行・郵便局にてキャッシュカードの再発行届け提出
  • 神山さんに返信
  • アプラスの書類作成
  • 学事にて、学生証を受け取る
  • 来往舎舞台設営のスタッフ探し

今日の行動

10:30 - 11:00

@町田。検察庁にて取調べを受ける。

11:00 - 12:00

@電車。『Protein Bioinformatics』Chap.2 を読む。BLAST の項がよく分からない・・・。

12:00 - 14:45

@研究室。ご飯食べたり、スガチャンのプログラムを書いたり。『Perl の便利屋さん』開業を決意する。

14:45 - 16:15

@矢上キャンパス。科学技術思想史の講義を受ける。

16:15 - 18:30

@研究室。BLAST についてサーベイする。ようやく、全体像が掴めだして来た気がする。

18:30 - 21:00

@研究室。KOG から 99 種のオーソログを集めてくるプログラムを Perl で書き、実行する。