Pukiwiki本家のURIは以下の場所に変更になっています。 http://pukiwiki.sourceforge.jp/ フッター部分のリンクを書き換えたほうがよろしいかと思われます。 また、本体は最新版である1.4.7が公開されています。 セキュリティホール等の不具合も修正されているそうなので、移行したほうがよろしいのではないでしょうか。 難しいとは思いますがよろしくお願いします。