FrontPage / 2006-08-29

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今日の予定

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@研究室。ぽーるとぱぱが来る。

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@研究室。序論と結論のストーリー展開を見直し、改良する。

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@自宅。ハンバーグを作る。

to do List

• 修論残り（dead line = 8/31）
  • 結果
    • dot-plot 図の描きなおし
    • 初期値依存性についての評価を改善
  • 考察
    • ストーリーの改善
  • 謝辞

• 修論研究の投稿
  • イントロダクション，ディスカッションのストーリーの練り直し。
  • 練り直しに伴う、追加実験
    • 網羅的な遺伝子クラスターの同定 etc.

• 博士課程進学手続き等
  • COE研究員RA申請 (dead line = 9/4 16:00)

• BSA 勉強会
  • 日程連絡

今日考えたことのメモ

• 僕の修論は、Result Paper か？ Method Paper か？
  • Method Paper である。
  • それでいて、Result Paper になろうともしている。

• では、イントロダクション，ディスカッションのストーリー展開は、Result Paper，Method Paper のどちらの展開を選択するか？
  • イントロダクションでは Method Paper の展開を選択し，ディスカッションでは Result Paper の展開を選択してみようと思う。
  • 独特で面白いでしょ！？

• 比較ゲノム解析には、どんな解析があるんだろう？
  • ぱっと思いつくのは、以下の通り。
    • シンテニー発見
    • オーソログ発見 ⇒ 遺伝子機能解析
    • ゲノム再編成シナリオの推定 (Reversal，Duplication etc.)
  • まー。Comparative Genomics とか、ゲノムブラウザーとかを見るに、こんな感じで良いんじゃないかなぁ。

• 序論の導入部を描いていて、Key Word による話題の推移の威力を実感。すげぇ。すげぇ。

• シンテニー領域と局所的ゲノムアライメント領域の違いって何！？
  • シンテニー領域は、ゲノム全体を俯瞰的に観察するために同定するもの。局所的ゲノムアライメント領域は、近隣遺伝子間の関係を観察するために同定するもの。
  • シンテニー領域はゲノムスケールな領域であり、約２０〜１００個程度の遺伝子を含む領域である。局所的ゲノムアライメント領域は必ずしもゲノムスケールな領域ではなく、５〜１０個程度の遺伝子を含む領域である。